Identifikation und Funktion regulatorischer RNA in dem phototrophen Modellorganismus Synechocystis sp. PCC 6803

Kleine regulatorische RNAs ohne Kodierungspotenzial für Proteine (non-coding RNAs, ncRNAs) regulieren sequenzspezifisch die Expression von Zielgenen und vermitteln dadurch Effekte in der Steuerung der Genexpression, der morphologischen Differenzierung und der Anpassung an sich verändernde Umweltparameter in pro- und eukaryontischen Organismen. Durch die Klonierung und Sequenzanalyse aller kleinen RNAs aus dem Cyanobakterium Synechocystis sp. PCC 6803 und die parallele Vorhersage von ncRNA-Genen in intergenischen Regionen mittels Algorithmen der Bioinformatik soll der Pool der in einem Cyanobakterium vorhandenen ncRNA-Gene möglichst umfassend erfasst werden. Durch die gezielte Erzeugung von knock-out Mutanten besonders viel versprechender ncRNA-Gene sowie von Genen für Enzyme mit Schlüsselfunktion im RNA-Metabolismus (RNase III, RNase E, Hfq) soll das - genetisch am besten untersuchte und am leichtesten zugängliche - Cyanobakterium Synechocystis sp. PCC 6803 zu einem echten Modellsystem für die Analyse regulatorischer RNA in Cyanobakterien aufgebaut werden. Eine im Rahmen der Vorarbeiten zu diesem Projekt identifzierte antisense RNA zur kodierenden Region des durch Eisenlimitation und Redoxstress induzierbaren Genes isiA soll hinsichtlich ihrer zellulären Funktion detailliert untersucht werden.