Funktionelle Analyse der lichtabhängigen Regulation der chloroplastidären Genexpression durch die Ribonukleoproteine CP31A und CP29A

Chloroplastidäre Genexpression ist gekennzeichnet durch eine hochkomplexe Transkriptreifung. Obwohl eine Vielzahl von plastidären RNA-Prozessierungsfaktoren beschrieben worden ist, wissen wir doch so gut wie nichts über die regulatorische Rolle der Transkriptreifung für die chloroplastidäre Genexpression. Wir schlagen vor, ausgewählte Mitglieder einer Familie von chloroplastidären RNA-Bindeproteinen, den cpRNPs, zu untersuchen, weil sie exponierte Kandidaten für eine lichtvermittelte Regulation der post-transkriptionellen RNA Reifung sind. Wir und andere haben gezeigt, dass cpRNPs lichtabhängig exprimiert werden und lichtabhängig mit mRNAs assoziieren. Eigene Vorarbeiten demonstrierten zudem, dass das cpRNP CP31A aus Arabidopsis in vivo mit multiplen mRNAs assoziert und bestimmte mRNAs zusammen mit anderen Faktoren stabilisiert und ediert. In Zukunft wollen wir verstehen, wie und wo cpRNPs an mRNAs binden, indem wir CP31A und das verwandte CP29A mittels einer Kombination von ribonomics- und klassischen in-vitro-Techniken analysieren. Parallel dazu werden wir die erwartete genetische Redundanz verschiedener miteinander verwandter cpRNPs über den Einsatz von Mehrfachmutanten auflösen. Schließlich werden wir die RNA-Bindung von CP31A und CP29A auf Transkriptom-weiter Eben in Abhängigkeit der Belichtung darstellen und prüfen, welche Rolle der Phosphorylierungsstatus dieser Proteine dabei spielt. Unsere Arbeiten sollen mechanistische als auch regulatorische Aspekte dieser außergewöhnlichen Proteinfamilie aufklären.