SFB/TRR 175/1: Von prädikativen zu mechanistischen Modellen der plastidären Genexpression mittels Hochdurchsatz-Sequenzdaten (TP D01)

Auf einen Blick

Laufzeit
07/2016  – 06/2021
DFG-Fachsystematik

Pflanzenwissenschaften

Lebenswissenschaften

Bioinformatik und Theoretische Biologie

Förderung durch

DFG Sonderforschungsbereich DFG Sonderforschungsbereich

Projektbeschreibung

Aktuelle Sequenziertechnologien und weitere –omics Methoden liefern wichtige Daten um zu verstehen, wie Akklimatisationsprozesse auf verschiedenen Ebenen der Genregulation gesteuert werden. Zur Integration dieser Daten werden wir ein hierarchisches Modell der Translation entwickeln, welches verschiedene Regulations-Ebenen über die Zeit berücksichtigt und so den Beitrag jeder Ebene quantifizieren kann. Des Weiteren werden wir neue Methoden zur Sequenzierung vollständiger, einzelner RNAs (Oxford Nanopore) anwenden, um weitere Einsichten zur Prozessierung, Modifikation und Translation der Chloroplasten-RNAs in Akklimatisationsprozessen zu gewinnen.